1989年，日本。　　乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发…

岛津丰久，一名活跃于战国时代后期的年轻豪杰。在一场撤退战中，为了掩护友军平安脱困而身受重伤。不料眼一眨，却赫见一名不明人物出现在眼前，并打开一扇门引他进入另一个由许多不同时空交错而成的奇幻世界。而从这一刻起，他便成了在这…

西历2011年，美国·佛罗里达州。　　在与恋人兜风途中遇到了交通事故的空条徐伦，因被陷害而获刑15年。深陷绝望之中的徐伦，在手握父亲所托的吊坠时，觉醒了不可思议的力量。徐伦面前出现的神秘少年，不断发生的不可思议的事件，前来探视…